通慧禅林始建于清初，相传开山祖师法名诵林。依九华山慧明禅师剃度出家，自食其力，不事募化，与东崖天籁轩吴襄深相默契。后来诵林祖师克勤克俭，自备材料在东崖西麓建造一座寺宇。上梁之前，诵林选了一个日子特意请吴襄斟酌。吴襄用天干地支稍加推算即说：“此非吉日，有恶星刹下凡。”诵林说：“万事万物相克相生，此非吉日，但有妙处。”最后他还是定此日上梁。上梁时，有一位长者从化城寺方向走来，问当家师傅：“今天并非好日，为何上梁?”诵林回答：“今日有恶星刹下凡，但有紫微高照福星化解。”长者听了不禁心喜，自言自语说了一声：“这和尚通慧。”诵林听得真切，赶忙上前双膝跪下：“谢我主龙恩，此庵有此造化，即以通慧为名。”原来，此位长者正是微服察访的康熙皇帝。从那以后九华山古刹群中又增加了一座大庙—通慧庵。

通慧庵在1821～1850清道光时为诗僧敬简所居。清咸丰年间毁于兵火。1881光绪七年住持僧0募化重建。1923年住持僧文泽。1925年～1937年住持僧宝严。1943年住持僧密如。1949年住持僧宝严。文革期间遭到破坏，寺庙破旧，佛像被毁。1986年住持比丘尼仁义法师用个人积蓄恢复重建本寺，规模如旧。寺院坐东朝西，大殿后东北侧与大花厅毗邻的为“小花厅”，2层3间楼宇，长9米、宽4米。大殿北侧是斋堂、僧房。西南面围有院墙，四周古木参天。院前溪水潺潺，曲径通幽。

仁义师太修复之后将寺院交于弟子思尚法师，1995年6月住持尼思尚在大殿北侧新建观音殿，民居式，砖木结构，建筑面积230平方米，内供7米高观音塑像。1995年11月比丘尼仁义法师85岁时圆寂。其徒遵师嘱，将其遗体坐缸存放。1999年1月开缸，其肉身完好，今装金供奉于通慧禅林，拟建悦殊殿以安放，成为九华山佛教史上第一尊比丘尼真身。2003年思尚法师重修大雄宝殿和悦殊殿。2010年冬将寺院托交于弟子如严法师。2011年如严法师重修山门，观音殿，小花厅，寮房。

释仁义，俗名姜素敏，1911年农历8月23日出生在辽宁省岫岩县一个富裕家庭。1940年秋，姜素敏奔赴山西五台山，在显通寺如愿以尝落发出家，取法名仁义。出家后，仁义一心向道，潜心修持，深入经藏，农禅并重。1942年，五台山战火连天，仁义师太离开五台山回到东北，入沈阳中医学院，专研学习四年，主攻中医学针灸一门。解放后，党的宗教政策是教育改造，因而仁义师太就返回原籍。1950年朝鲜战争爆发，仁义参加中国人民志愿军，并于1951年随军奔赴朝鲜。在朝鲜的3年里，仁义吃尽了千辛万苦，抢救医治了无数伤残军人。文革期间1966——1970年仁义师太潜心学佛每天上香诵经，被通化市光明街道办事处关押，原因是宣传封建迷信思想和言论。

在六十年代和七十年代那特定的历史时期，仁义法师以她特有的修持方式，认真工作，勤奋劳动，不图名利，不计得失，行医看病广行善事，顺逆境中自净其意。十一届三中全会后，宗教政策得到落实，仁义法师于1982年再度赴五台山，在塔院寺受具足大戒。同年重修南山寺。1983年仁义法师朝礼九华，先后住甘露寺、菩提阁等寺庙，最后住通慧禅林，并倾其所有修复寺宇。此后，仁义法师不顾年高，又外出-行医。她赴邯郸、奔石家庄、走浑源、上五台，一路修庙，一路行善，一路结众生缘。

1995年4月，仁义从五台山返回九华山通慧禅林。同年农历10月7日圆寂，享年85岁。思尚法师遵其遗嘱，按佛教仪规将其坐缸。1999年1月2日，思尚法师打开存放已3年零2个月的坐缸，见仁义师太端坐在缸里，黑白相间的头发长出寸余，牙齿完好，皮肤毛孔清晰，身体尚有弹性；入缸时十指相向的手势已有变化，右手稍抬高作捻针状，这是她几十年来为病人扎针的姿势，其肉身现供奉于通慧禅林。