在众多的遗迹中，昆明的杨升庵祠，保存时间长，瞻仰的人多，影响也较大。最近，昆明市人民政府，已交给西山公园重修后作为杨升庵和徐霞客的纪念馆。昆明杨升庵祠，在碧鸡山麓，高
村东南，与现高
供销社隔公路相对。祠旁有普贤寺，寺据山脉结穴处，形如奔马顿辔兀立。相传，寺建于汉，内供普贤菩萨，因以名。明初，有僧玉琳重建，清康熙年间继修。寺内有殿二院，前院供普贤菩萨，后院供观音；左厢房名“曙霞”，右厢房名“幽月”。天井中绛桃、杜鹃、梅花、山茶繁盛，罗汉松、银杏树大可合抱，高撑云天，远观林木蔚然，是西山古刹名胜之一。前殿匾曰：“山海供养”，门联为：“自东汉以来，二千年变幻沧桑，重开古刹；位西山之麓，五百里苍茫云水，一荡尘襟。”可想见其历史及景致。
升庵祠就在普贤寺南，仅一墙之隔。这里原是乡绅毛玉的庭园。毛玉，字国珍，又字用成。世宗时，在京任吏部给事中，与杨慎相友善。在议大礼这场政治斗争中，毛与群臣一起“伏阙争大礼”，被逮下狱，廷杖创发致死（见《明史》本传）。毛玉殁后，杨慎在《毛给谏遗像赞》中称其“抗疏清节，直节劲气。奋弗顾身，独立不惧。仁成一朝，名香百祀”。又有《吊毛用成》诗二首。其一云：“阙下苍茫别，泉台汗漫游。丹心事君毕，白发我生浮。四海英雄泪，三年魑魅愁。临风谁与问，天道信悠悠。”足见他们生前友谊非同一般。杨慎谪滇，毛玉之子邀请杨慎在家中住下，嘉靖十六年，又为他建别墅，名曰“碧
亦吾庐，安宁亦吾宅。屏居三十年，宛如故乡陌。”（《晨发高
柬邱月渚杨墨池》）升庵死后，当地人士于万历中以“碧
精舍”作为祠堂纪念他，清康熙二十八年重修。辛亥革命后，绅耆增毛玉柱共祀一堂，更名杨毛二贤祠。
杨慎在高时，村中李圣谟（字近楼）对他十分钦仰，时与杨慎往还。圣谟长于绘画，曾为杨升庵画像一幅，藏于家中，后又复制了一幅给大理斑山海光寺雪老和尚悬挂在“写韵楼”上。康熙年间重修升庵祠进，总督范承勋征集升庵像，普贤寺僧献出。据说，他在兵荒马乱的年代，带着这张画像逃匿他方，才得以保存。范承勋十分珍视，命画工将它摹在素绢上，装璜后送祠悬挂，原本仍交寺僧收藏。（见《杨庄介公遗像赞·序》）后人瞻仰遗像，睹其风采，多有诗记：“图绘须眉端复庄，满腔国事忧方长”；“祠中古柏两三秀且僵，仿佛傲骨撑冰霜。”（刘大绅《访太史祠》）祠中原有升庵竹杖，高五尺许，四川大节竹，自镌铭：“中空外直，劲节虚心。”曾有人“借”去不还。辛亥革命后，僧镜如向昆明令言及此事，下令索回，制匣送省立博物馆。时人曾有诗云：“新都公子老滇中，一杖优游士类从。化作邓林犹自可，莫教飞去化为龙。”这枝镌铭竹杖，不仅反映了升庵的思想人格，也使人
联想起杨状元当年风尘仆仆，漫行云南高原，探考三迤胜迹的行状。
升庵祠前有腊梅十余株，每当冬末初春，香迎远近，芬芳暗袭。游人每上《高见梅忆升庵》：“更上高
紫翠台，台西犹见老梅开。可怜疏影横斜月，不见先生一再来。”（贾惟孝）从遗迹考查，升庵祠格局不大，仅一殿、两庑，加门楼，但小巧，似较宽敞的中式院落。天井内旧有古柏二三株，翠竹几蓬，且有寒泉入内，凿有小池，旁植花，环境清幽。祠宇所在地，地势高朗，背山面湖，景致颇佳。升庵祠自明嘉靖中建立以来400年间，不论达官贵人，名人学士，本地庶民，或过往客商，都纷纷慕名前往观瞻，留下了无数珍贵的诗篇。有赞颂升庵的思想品格，有的表彰他对云南文化的贡献，有的抒发对先哲的怀念。“先生旧栖此，遗迹空莓苔，滇池一片月，犹为前贤来。”（罗恩觐《半月山怀升庵太史》）透过这些感情深厚的诗句，足见杨升庵一直活在云南人民心中。
