灵官殿又名主君阁。灵官是道教的0神，一般布局在较大的道观两侧。但巍宝山前山的灵官殿却是独立的单一殿宇，与玉皇阁在同一轴线上，灵官殿成了玉皇阁的山门。

灵官殿始建于明末清初，清咸同年间被毁，光绪年间进行过复修。正殿内曾祀有一座青铜铸造的王灵官像，重达200余公斤，灵官手执的金鞭为铁铸，整座神像十分壮观，可惜1958年-时被毁。殿内现在的灵官像为泥塑，赤面，三只眼。殿内供奉的炳灵太子，又称华光大帝，是南方道教特有的神人，民间称之为“火神”。

灵官殿内有明代晚期种植的“桂叶银红”山茶花树两棵，今仅存一棵。古山茶树高十六七米，直径约15厘米，是世界上现存最高的大理山茶花。每到春季，山茶花开数百朵，大花如碗，红似胭脂，异常艳丽，远远看去好像一片云霞依半空，近看像灿烂的红日光彩照人，古人誉其为“山茶流红”的胜景。相传，古山茶原生长在深山丛林中，明末清初修建灵官殿时，道人把它移栽到殿内，距今已有三四百年的历史。这株至今仍生长茂盛的古山茶已被作为名树古木加以保护。

古代苏州文人陈全钰曾写诗赞美这株古山茶，诗句如下：“丛深春藏不闻莺，露下啼妆别有情，可惜琼葩因僻远，分心馨口独含颦。”将这株“桂叶九心十八瓣”的山茶珍品写得美丽羞涩。