莲花寺，藏语称努瓦姆岱，是萨班广授显宗佛法之道场。他的妹妹索巴让摩，在这丛出家修行，长期在静修处坐禅。萨迦班智达在百塔寺患病期间，她经常去探视，并询问永别的时间。—次听到法王圆寂的消息，她说：“藏族的后代今后躺着死，索巴让摩站着死”。话音刚落便圆寂了。圆寂后将其灵骨舍利、两颗牙龄，装入用生铁铸成的佛像里，供奉于殿内。
据熟知莲花山名胜古迹的李忠文先生考证，莲花山原有寺庙、道观72处，亭榭、楼阁、僧房、塔、庭院等建筑999间，寺庙依山而建，殿宇相望，规模宏伟，环境优美，山泉秀丽，景色宜人；佛、道塑像壮严，栩栩如生；壁画技艺高超，线条流畅自如；门柱匾额，书法挺拔俊秀，艺术价值极高。现存遗址：佛教有善应寺即莲花寺、莲花殿、达摩庵、极乐宫、西竺寺、弥勒殿、准提殿、无量殿、观音殿、眼光殿、转轮殿、韦驮殿、百塔寺、大观音殿、小观音殿、大悲阁、白衣洞、佛塔殿、接引寺等。道教有玉皇阁、五龙宫、上台子殿、药王殿、华陀殿、三教殿、牛王马祖殿、三皇殿、五岳殿、三宫殿、孤魂殿、龙王殿、雷祖殿、娘娘殿、七星殿、土地殿、土地祠、黑虎财神殿、三星殿、油驮殿、春秋阁、木帮殿、三霄殿、新百子阁、旧百子阁、文昌宫、魁星阁、王母殿、无生0殿、地母殿、灵宫殿、老君洞、功德殿等。另有上朝阳洞、下朝阳洞、上天桥、玉带桥、关煞洞、头天门、二天门、上天门等设施建筑。
现存文物古迹有金顶塔、上天桥、玉带桥、曾文石、药王泉及古钟一口、石碑一通。
历代文人墨客多到莲花山抒情咏诗作画，以赞山势之奇巍壮观。唐朝诗人高适《和窦侍御登凉州七级浮图之作》、元朝西藏佛教领袖萨班法王在莲花山讲经灌顶，萨班之妹坐禅修行而圆寂在金顶处，明代戴弁作有 《咏塔诗》及清代武威人张召美作有《夏五游莲花山四首》诗，陈炳奎作《兽文石歌》。更有著名画师张大千两次登临莲花山，赞美山势雄奇壮观，画有《莲花山》图一幅 (此画现存天津人民美术出版社)。其画题跋云：“武威西南莲花山梵宫琳宇，犹多口口之元明结构，一览之胜，口口两登绝顶，此大痴樵，方家法写之，用作游记，乙酉七荷月爰。”武威满族人丁美如于民国二年作《莲花山画》 一幅观存，题诗：“叠嶂重峦翠屏开，莲峰金顶映楼台。虹梁例挂悬飞瀑，羊肠曲径带环迴。烟霭晴云接霄汉，钟产乐韵天半来。偶兴绘成可卧游，以免跋涉碌形骸。”这两幅诗画佳作，生动逼真地描绘了莲花山自然与人文的奇妙景观，使探胜者读后有一种身临迴其景之感。
莲花山镇魔塔(又名金顶)，坐落在莲花山腹的诸寺之巅，称文殊师论菩萨塔，其塔之位置，恰是索巴让摩站着圆寂的地点，也是班禅授灌顶时取净瓶水与彩粉的地方。此塔是仿印度楼阁式建筑，塔内供有药师佛等像。塔侧拉强沟里有一眼清泉，称药王泉，泉水清凉。农历5月13日的庙会，数万人畜上山，均饮用此水，传说水能治病。泉边有一磐石，相传此处原无水，是索巴让摩用脚踏动了磐石后，出现了泉水，石上留下她的足迹。至今塔身裂缝，但仍巍然耸立于山腹之上，站在城内高地，向西眺 望，天气晴朗时，塔身可见。
