展馆内设有《源远流长——中国大运河文化展》，全面展示中国大运河沿途35座城市的历史文化和人文风情，展示古城扬州在悠久运河史中的历史地位和重要作用。展览主要分为历史篇、航运篇、交流篇、城市篇、遗产篇、申遗篇等六部分组成，从大运河“历史”和“地域”两个维度着手，根据有关运河实物、绘画、史料等资料，提炼能够展示运河风采的内涵元素和形式元素，进行布展。展览将色彩运用和灯光手段完美结合，并使用vr技术和地面投影互动手段增强项目趣味性，同时以绘画、灯光、音响、舞台制景、声光电展版、动态半景画等技术，强化视觉冲击力。

大运河文化展示馆已成为扬州的又一张城市名片，已成为与世界运河文明对话的平台，为扬州与世界各地的运河城市加强交流、互通有无、共谋发展做出了重要贡献。